陆军军医大学第二附属医院医学工程科，于1987年从药械科中独立出来建科，2018年行政编制变更为医学工程科，现为国家医学装备管理与技术保障培训基地、国家医疗器械临床使用管理规范培育基地、重庆市医学装备质量控制中心、重庆市数字诊疗装备工程技术研究中心。全科现有工作人员共119人，其中副高级职称以上人员6人，中级职称人员10人，初级职称及以下人员103人，博士4人，硕士9人。科室主要负责医院医疗器械管理和技术保障、教学及科研相关工作，下设设备保障组、耗材保障组、质量管理组、综合组、科研教学组、消毒供应室等6个室组。

建科以来，科室获得国家、军队、重庆市等各级各类课题20余项，总经费近2700万元，发表论文300余篇，其中SCI、EI、ISTP论文15篇，授权国际发明专利2项，发明专利9项，实用新型专利60余项，软件著作权8项；获得军队科技进步二等奖1项，军队科技进步三等奖1项、军队科医疗成果三等奖2项；主编并出版专著5部；成果转化1000万元。