陆军军医大学第二附属医院胸外科是国家重点学科、全军临床重点专科、重庆市高校重点学科、重庆市临床重点专科、重庆市肺结节与早期肺癌专病诊疗中心、新桥医院肺磨玻璃结节诊治中心、中国胸外科联盟重庆肺结节诊疗中心、中国医师协会胸外科分会重庆手汗症诊疗基地。学科组建于1952年，为国务院最早批准的硕士/博士学位学位授权学科。国家住院医师规范化培训基地和住培骨干师资培训基地。

科室临床技术特色突出，在肺癌方面专注于肺小结节与早期肺癌的精准诊断，现已在国内处于领先水平，成为了全国磨玻璃肺癌手术量第一的单中心。率先开展了肺磨玻璃结节无创定位技术、肺磨玻璃结节人工智能诊断技术、亚肺叶切除新术式等一系列新技术，特别是疑难多原发磨玻璃肺癌手术已成为全国领先的特色优势技术。每年度向基础部队医院推广诊疗技术数量超过30项。我科开发了人工智能诊断分析技术系统、精准无创液体活检的临床诊断体系，使其肺结节的诊断准确率达98%，专科门诊量跃居市内第一。其他医疗特色技术还包括:1、胸部肿瘤的微创外科治疗:达芬奇机器人手术、单孔/三孔胸腔镜下肺癌根治术、胸腔镜下纵膈肿瘤切除术、胸腔镜下食管癌根治术等;2、体外循环下局部晚期肺癌的外科手术治疗:3、肺部良性疾病的外科治疗:支气管扩张、肺大疱、气胸、脓胸和肺结核等的外科治疗;4、手汗症的超微创手术治疗。依托网络平台义诊患者数量超10万人次，发布科普超过500万字，影响力席卷全国，科室互联网排名连续4年进入全国前十。

近年来，科室先后主持国家自然科学基金、中央引导地方发展专项、川渝重点研发计划项目、以及其他省部级和军队项目等科研课题40余项，在研总经费2000余万元。发表论文100余篇， 其中SCI 71篇，10分以上的三篇，最高IF17.5；主编专著3部，副主编专著2部；近五年获国家自然基金地区重点项目等国家、省部级课题10余项；获中华医学会教学研究成果奖1项；获国家发明专利和实用新型专利50余项。